أنشئ المعهد العالي لتأهيل واعداد الائمة والدعاة استنادا الي قرار مجلس الاساتذة رقم ( 5) فقرة (4) لسنة 2002 م بتاريخ ربيع الثاني 1423هـ الموافق له 13/5/2002م وقرار اللجنة التنفيذية رقم (5) لسنة 2005 م في دورتها الثالثة وتوصية اللجنة الادارية في اجتماعها رقم (3) لسنة2000  م

وذلك بحسبان أن جامعة ام درمان الإسلامية منذ نشأتها في الربع الأول من القرن الرابع عشر الهجري نحو سنة 1900م علي أيدي الأئمة والدعاة من قيادات العلم والفكر الاسلامي بالسودان ، تحت اسم المعهد العلمي ، وبتطور الجامعة يأتي المعهد العالي لتأهيل واعداد الائمة والدعاة اضافة معاصرة وماسة لحزق المهارات وتأهيل وترقية أداء الائمة والدعاة وفق برامج إعدادية وتدريبية ، علمية وأكاديمية وتقنية ،تناسب التطور المعرفي والثقافي الهائل الذي يعيشه العالم اليوم .

ولعل الاتجاه نحو التخصص الدقيق والعميق في الدراسات ذات الصلة المباشرة بتأهيل الائمة ، يلبي ( حاجيات ) ملحة للائمة والدعاة في عالم اليوم الذي أحوج ما يكون للهداية حيث تتعاظم أهمية المنابر والكلمة في هذا الشأن

قال تعالي (ألم تري كيف ضرب الله مثلا كلمة طيبة كشجرة طيبة أصلها ثابت وفرعها في السماء تؤتي أكلها كل حين بإذن ربها و يضرب الله الأمثال للناس لعلهم يتذكرون )

وقال تعالي( أدعو الي سبيل ربك بالحكمة والموعظة الحسنة وجادلهم بالتي هي أحسن ان ربك هو أعلم بمن ضل عن سبيله وهو اعلم بالمهتدين )